海南国家公园研究院与清华大学碳中和研究院、北京师范大学环境与生态前沿交叉研究院、中国社会科学院生态文明研究所、中国科学院西双版纳热带植物园、中国科学院动物研究所、海南大学、海南师范大学、海南省院士联合会等机构签订5年的战略合作协议；以项目为纽带，与北京大学、武汉大学、中山大学、北京林业大学、中国林科院等机构建立良好合作，建成了300余人的专家库。
海南国家公园研究院与阿拉善SEE生态协会、海南省蓝丝带海洋环境保护协会、山水自然保护中心等公益组织签订了战略合作协议，建立良好合作关系。
海南国家公园研究院与世界自然保护联盟（IUCN）、联合国教科文组织（UNESCO）等国际组织建立了良好合作关系。
